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吉林市氣象災害防御指揮部辦公室：負責組織落實指揮部各項決議、政策和工作部署。制定年度工作細則，并督促檢查各項工作落實情況，并對各地氣象災害防御工作進行指導。負責全市特大、重大氣象災害應對、處置過程中的信息收集、傳達、報送和協調工作。負責指揮部會議議題的收集和會議籌備，負責起草各類文件。負責建立各成員單位聯絡員制度，組織召開聯絡員工作會議。負責編制工作簡報，搭建形式多樣的部門間信息交流平臺，建立信息互通機制。
吉林市人工影響天氣指揮部辦公室：負責制定和實施全市人工影響天氣工作的發展規劃和計劃；組織、協調、指導全市人工影響天氣工作；負責全市人工影響天氣作業的組織指揮、技術指導工作；負責人工影響天氣作業的雷達監測、設備維護和維修；負責全市人工影響天氣的天氣作業的計劃供應、安全管理工作；負責組織全市人工影響天氣工作的技術總結、交流、推廣及災情收集、效益分析和技術檔案的建立；負責組織全市人工影響天氣作業人員的崗位培訓及技術考核；主動向政府領導匯報全市人工影響天氣的工作情況，提出作業方案或建議。
吉林市雷電防護領導小組管理辦公室：組織協調全市雷電防護管理工作。制定雷電防護設施安全管理辦法。為政府防雷減災提供決策依據，指導雷電防護安全及宣傳工作。組織雷電防護新技術、新產品的引進、推廣、開發和研制工作。組織全市雷電防護重大工程及設計方案的技術論證和監督工程的實施。開展雷電災害統計和重大災害的調查。培訓雷電防護檢測和防雷工程專業技術人員別墅大門。對全市防雷裝置檢測、設計、安裝，防雷工程的設計審核、施工監督、竣工驗收和雷電災害防護裝置產品認可的組織管理。在本行政區域內，負責對從事防雷裝置檢測、防雷工程專業設計和施工的單位行資質管理。
吉林市施放氣球管理辦公室：對本行政區域內施放氣球活動進行指導、監督、檢查。做好本行政區域內施放氣球工作的技術指導和全市施放氣球管理工作的現代化建設。負責組織本行政區域內施放氣球管理工作會議、技術培訓及經驗交流等活動。負責本行政區域內施放氣球政策法規的宣傳。負責制定的配套管理文件、工作程序條款的解釋。負責與本行政區域內飛行管制等部門的工作協調。定期與相關部門聯合進行施放氣球安全生產檢查活動。制定本市施放氣球活動安全措施和處置預案。做好本行政區域內施放氣球單位資質的認定、年檢及施放氣球作業審批及相關材料的上報。負責本行政區域內施放氣球活動的安全監督、管理和行政執法；組織對施放氣球責任性事故的查處以及管理材料的上報。
吉林市氣象行政審批辦公室：負責全市歸口管理氣象行政許可和行政審批事項受理、審查、批準；制定氣象行政審批各項制度、辦法、審批流程，組織行政審批培訓，行政審批工作監督管理等工作，負責氣象立法工作。
